Rezort Miroslava Kalouska (TOP 09) zdůvodnil předložení zákona téměř dvěma desítkami úprav. Například z novely evropské směrnice o společném systému daně z přidané hodnoty vyplynula nutnost změn pravidel fakturace. Týkají se daňových dokladů, jejich vystavování a uchovávání i zrovnoprávnění dokladů v elektronické a listinné podobě.

Novela má umožnit volbu převodu nemovitostí po zákonné lhůtě jako zdanitelného plnění, tato lhůta bude navíc místo tří let nově pětiletá. Další novinky souvisejí se zavedením institutu identifikované osob a navázaných změn. Mezi ně patří zrušení náhrady za nesplnění registrační povinnosti nebo úpravy při zrušení registrace plátců a identifikovaných osob.

Daňové osvobození pojištění a zajištění se podle zákona bude vztahovat už jen na pojištění skutečně poskytnuté. Norma ruší nárok na daňovou vratku pro unijní úředníky a přináší změny v uplatnění nároku na vrácení daně fyzickým osobám ze třetích zemí při vývozu zboží. Ty už nebudou muset vyplňovat tiskopis.

Úpravy se týkají také správy daně, kde chce ministerstvo účinněji bojovat s úniky u DPH. Novinkou má být povinnost podat daňové přiznání elektronicky, rozšíření evidence údajů vedené pro daňové účely a úprava zdaňovacího období u nově registrovaných plátců.

Norma mění pravidla pro změnu zdaňovacího období i stanovení důvodů a postupů pro zrušení registrace plátce správcem daně při závažném porušení povinností plátce vůči správě daní.

Zákon zavádí také institut takzvaného nespolehlivého plátce. Jména takových osob mají být zveřejňované s tím, že příjemce plnění bude ručit za daň nezaplacenou poskytovatelem plnění. Úprava přijde do hry ve chvíli, kdy v okamžiku uskutečnění plnění bude veřejně známé, že pochází od takového nespolehlivého plátce.

Další novinky přineslo připomínkové řízení. Na jeho základě mají daňové subjekty uvádět v přihlášce o registraci povinně své účty používané pro ekonomickou činnost. Použití jiných účtů než takto přiznaných má být nově důvodem pro to, aby příjemce plnění ručil za daň nezaplacenou poskytovatelem.

Zákon stanovuje i povinnost ručení za DPH pro oprávněného příjemce a provozovatele daňového skladu v souvislosti se vznikem povinnosti přiznat a zaplatit spotřební daň. Má také zajistit větší právní jistoty při aplikaci režimu přenesení daňové povinnosti při poskytnutí stavebních nebo montážních prací.

Po schválení vládou, parlamentem a prezidentském podpisu má norma začít účinkovat od 1. ledna 2013. Turisté ze třetích zemí se ale změn ve v daňové vratce dočkají až od 1. dubna. Speciálně nastavenou účinnost má pasáž, která snižuje hranici obratu pro registraci plátce DPH z jednoho milionu korun na 750 tisíc korun, ta je navázaná na účinnost celého balíku daňových změn.